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象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

[所属分类:行业动态] [发布时间:2022-5-16] [发布人:网站管理员2] [阅读次数:] [返回]

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
作者：朱汉斌来源：中国科学报
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中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队，在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者，华南植物园教授葛学军和法国农业科学中心教授Mathieu Rouard参与该项工作。
象腿蕉是芭蕉科中耐寒的蕉类植物，原产于中国云南和东南亚地区，具有重要的观赏、饲用和药用价值。研究人员采用单分子纳米孔、Illumina测序策略，结合染色体构像捕获技术，发表了首个象腿蕉染色体级别的基因组序列，长度为481.5 Mbp，完整性较高（BUSCO 98.3%），注释获得36,836个编码基因，重复序列约占基因组的55%。
象腿蕉与芭蕉属代表物种的比较基因组学研究发现，象腿蕉的长末端重复序列的组成及其插入时间，与芭蕉科其他物种均有差异，芭蕉属比象腿蕉属有更多Copia，象腿蕉LTR插入时间（峰值3.5–5 Mya）比芭蕉属物种（峰值2 Mya）更古老，还发现芭蕉科在9和11染色体基数进化过程中复杂多样的染色体重组事件。该研究结果为蕉类作物保育和改良提供重要的基因组资源。
该研究工作得到了华南植物园海外知名学者项目、国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金的资助。
相关论文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giac027

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