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我国科学家实现水溶液蛋白质二级结构动态探测
[所属分类:行业动态] [发布时间:2025-11-21] [发布人:杨晓燕] [阅读次数:] [返回]
我国科学家实现水溶液蛋白质二级结构动态探测
作者:甘晓 来源:中国科学报
山东拓普生物工程有限公司 http://www.topbiol.com
近日,国家纳米科学中心研究员杨晓霞团队、香港大学教授张霜团队及上海交通大学教授戴庆团队联手,将前沿红外传感技术与注入了物理知识的深度学习模型相结合,实现了在真实水溶液环境中,对纳米尺度蛋白质二级结构的实时、精准动态捕捉。相关研究成果在《科学进展》上发表。
蛋白质是生命的基石,但它们并非静止不动。实时“看清”它们在水溶液中的结构变化,是理解生命奥秘、开发新药的关键。但是,水分子的强烈信号常常淹没蛋白质微弱的二级结构信息,难度堪比在“狂风暴雨”中听清“耳语”。传统的红外光谱技术在攻克这个难题上一直收效甚微。
为此,研究团队设计了一套“双剑合璧”的创新方案。“第一剑”是打造超灵敏“信号放大器”。团队研发了一种石墨烯/金复合超表面传感器。它能将光的能量高度压缩,形成一个可与单个蛋白质尺寸相当的“热点”区域(仅约13平方纳米),将被测蛋白质“锁定”其中,同时将绝大多数“水噪音”排除在外。这使得过去无法捕获的、极其微弱的蛋白质二级结构变化信号得以清晰呈现。
“第二剑”是训练懂物理的“智能解码器”。 传统AI模型需要海量数据“投喂”才能学会分析,但在该领域高质量数据极为稀缺 。为此,团队创新地开发了物理增强卷积神经网络(P-CNN)模型 。他们通过迁移学习,先将光谱学的物理规律“教会”AI,让它自带“先验知识”上岗 ;同时引入合成复频率波的损耗补偿机制,从而显著提升二级结构的光谱特征对比度。这一设计使PE-CNN仅依靠少量实验数据即可实现高效、准确的二级结构比例解析,无需复杂数据预处理。
这项“传感+AI”的新方法,不仅为在真实生理环境下验证AlphaFold等蛋白质结构预测模型提供了关键实验依据,也为研究复杂生物分子相互作用、推动药物筛选和仿生制造等领域开辟了新路径。
相关论文信息:http://doi.org/10.1126/sciadv.adw0783
(本文内容来源于网络,版权归原作者所有,如有侵权可后台联系删除。)
作者:甘晓 来源:中国科学报
山东拓普生物工程有限公司 http://www.topbiol.com
近日,国家纳米科学中心研究员杨晓霞团队、香港大学教授张霜团队及上海交通大学教授戴庆团队联手,将前沿红外传感技术与注入了物理知识的深度学习模型相结合,实现了在真实水溶液环境中,对纳米尺度蛋白质二级结构的实时、精准动态捕捉。相关研究成果在《科学进展》上发表。
蛋白质是生命的基石,但它们并非静止不动。实时“看清”它们在水溶液中的结构变化,是理解生命奥秘、开发新药的关键。但是,水分子的强烈信号常常淹没蛋白质微弱的二级结构信息,难度堪比在“狂风暴雨”中听清“耳语”。传统的红外光谱技术在攻克这个难题上一直收效甚微。
为此,研究团队设计了一套“双剑合璧”的创新方案。“第一剑”是打造超灵敏“信号放大器”。团队研发了一种石墨烯/金复合超表面传感器。它能将光的能量高度压缩,形成一个可与单个蛋白质尺寸相当的“热点”区域(仅约13平方纳米),将被测蛋白质“锁定”其中,同时将绝大多数“水噪音”排除在外。这使得过去无法捕获的、极其微弱的蛋白质二级结构变化信号得以清晰呈现。
“第二剑”是训练懂物理的“智能解码器”。 传统AI模型需要海量数据“投喂”才能学会分析,但在该领域高质量数据极为稀缺 。为此,团队创新地开发了物理增强卷积神经网络(P-CNN)模型 。他们通过迁移学习,先将光谱学的物理规律“教会”AI,让它自带“先验知识”上岗 ;同时引入合成复频率波的损耗补偿机制,从而显著提升二级结构的光谱特征对比度。这一设计使PE-CNN仅依靠少量实验数据即可实现高效、准确的二级结构比例解析,无需复杂数据预处理。
这项“传感+AI”的新方法,不仅为在真实生理环境下验证AlphaFold等蛋白质结构预测模型提供了关键实验依据,也为研究复杂生物分子相互作用、推动药物筛选和仿生制造等领域开辟了新路径。
相关论文信息:http://doi.org/10.1126/sciadv.adw0783
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