新方法评估基因转录物降解受到的调控

[所属分类:新闻动态] [发布时间:2020-3-9] [发布人:] [阅读次数:] [返回]

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Hubrecht研究所(KNAW)的研究人员开发了一种新方法来评估基因转录物的产生和降解受到调控。在这项研究中，他们发现细胞使用不同的策略来控制转录本拷贝的数量，这是细胞正常运行所必需的。

我们的身体由数万亿个包含相同DNA的细胞组成。即使每个细胞中的DNA相同，我们也由许多不同的细胞类型组成，每种细胞具有不同的功能。在不同的细胞类型中，DNA上不同的基因组是有活性的-使用不同的配方来构建细胞的成分。反过来，这又决定了它是哪种细胞，例如皮肤细胞或肌肉细胞。为此，细胞会复制可用于生产蛋白质的所谓基因的副本。

平衡创造与破坏

细胞中每个基因的转录本数量是这些基因活性的量度。可以通过制作新副本(称为转录过程)和销毁已存在的副本(称为降解过程)来影响此数字。在单个细胞中，转录本拷贝数通常是通过分解细胞来测量的，因此在同一细胞中不能随时间追踪。因此，到目前为止，尚不清楚单个细胞中转录和降解的组合如何调节特定转录本的拷贝数。

标记新副本

Alexander van Oudenaarden，Hans Clevers和Marvin Tanenbaum小组的研究人员着手解决这一问题，方法是开发一种新的单细胞测序技术，以区分新鲜制作的转录本和已有的转录本。

独特的策略

通过将这些数据与计算机模型相结合，研究人员可以发现，转录和降解都与调节转录本的拷贝数量密切相关。Battich：“细胞似乎使用不同的策略来调节其基因的活性或这些转录本的拷贝数。对于某些基因，细胞必须能够非常迅速地改变拷贝数。这些基因都在通过同时参与这两个过程，细胞能够非常快速地改变拷贝数，例如同时减少转录和增加降解。

这种称为scEU-seq的新方法可用于研究众多过程，例如发育过程中的细胞专门化，健康和癌症系统中细胞分裂的调控。