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新型抗生素可让细菌爆炸
山东拓普生物工程有限公司
Shandong Tuopu Biol-Engineering Co.,Ltd
历时四年的不断探索,美国东北大学 Kim Lewis教授团队再次发现一种新型抗生素——darobactin, 一种发光杆菌的代谢产物,含有7个氨基酸的短肽,可通过结合一个关键外膜蛋白bamA,选择性杀伤革兰氏阴性菌。本文提出一种新的杀菌机制,即通过抑制bamA外膜蛋白,破坏细菌外膜诱导细胞裂解,最终导致细菌原地爆炸。
图1 Darobactin 结构
研究人员从67株嗜线虫致病杆菌和发光杆菌的代谢产物中,发现发光杆菌可产生抑制大肠杆菌E.coli的生长的化合物。经高效液相色谱和高分辨质谱的分离鉴定,NMR核磁结构分析,鉴定出该有效化合物为含有7个氨基酸的短肽W1-N2-W3-S4-K5-S6-F7,分子量996.4(如图1)
荧光显微镜下观察发现大肠杆菌在darobactin作用后出现气泡、肿胀、爆炸的细胞形态。由于通常小于600Da的小分子才可以穿透细菌外膜,因此首先考虑该抗生素是否如多粘菌素一样作用于外膜的脂多糖LPS,但是结果发现添加LPS对darobactin杀伤大肠杆菌的效果并没有显著影响;继而研究者推测该短肽分子的靶标可能是外膜蛋白。为进一步探索darobactin的特异性结合蛋白,大肠杆菌在darobactin的sub-MIC压力下连续传代7天,获得三株darobactin耐受的菌株,对三株耐药菌株进行基因测序发现在一个关键外膜蛋白bamA的基因编码区出现了2-3个相同的突变,接着将这三个突变位点在野生型大肠杆菌中做等位突变,发现该野生型大肠杆菌即对darobactin出现显著耐药性,表明darobactin的靶标蛋白即bamA。最后研究人员通过小鼠实验,分别将敏感型和耐药性的大肠杆菌、绿脓假单抱杆菌以及肺炎链球菌注射入小鼠腹腔,发现darobactin均可以有效提高小鼠的生存率。
图2 Darobactin的结合靶点bamA外膜蛋白
在耐药菌传播速度加快而抗生素开发极其缓慢的当下,Kim Lewis教授团队开发的新型抗生素无疑给全球健康带来了新的曙光。本文不仅鉴定出Darobactin 的结构,而且提出新的抗菌机制——结合关键外膜蛋白bamA,破坏细菌外膜诱导细胞裂解,导致细菌爆炸。
图3 Darobactin作用于E.coli不同时间内细胞形态的变化